Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK2Q8IWQ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK2Q8IWQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms