Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD3Q8IVD9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUDCD3Q8IVD9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms