Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA4Q8IV77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms