Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC80Q76M96 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms