Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251 ms