Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP34Q70CQ2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP34Q70CQ2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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