Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR3Q6ZT12 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR3Q6ZT12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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