Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC23Q6ZST2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC23Q6ZST2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms