Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC141Q6ZP82 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC141Q6ZP82 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC141Q6ZP82 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms