Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms