Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARA5Q6ZMJ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms