Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD109Q6YHK3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD109Q6YHK3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms