Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC4Q6S5L8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC4Q6S5L8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms