Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL35Q6PF15 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms