Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC41PQ6P2S7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC41PQ6P2S7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC41PQ6P2S7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms