Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC144NLQ6NUI1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms