Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDE2Q6IQ49 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms