Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL3Q6DD88 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL3Q6DD88 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms