Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARP1BQ659C4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARP1BQ659C4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 554.7 ms