Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHEQ5VZ18 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms