Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms