Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD13Q5VXD3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms