Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRCH2Q5VUJ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms