Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms