Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR78Q5VTH9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms