Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP350Q5VT06 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms