Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRIP1Q5VSL9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRIP1Q5VSL9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRIP1Q5VSL9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms