Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGEF3Q5TH69 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGEF3Q5TH69 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGEF3Q5TH69 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGEF3Q5TH69 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGEF3Q5TH69 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms