Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHYHD1Q5SRE7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHYHD1Q5SRE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms