Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms