Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47AQ5JRC9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM47AQ5JRC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms