Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms