Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XKR4Q5GH76 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XKR4Q5GH76 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms