Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SDK2Q58EX2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDK2Q58EX2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms