Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBK1Q52WX2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SBK1Q52WX2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms