Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGAP29Q52LW3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms