Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREB1Q4ZG55 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREB1Q4ZG55 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms