Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A4Q4VNC1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms