Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4G0T1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4G0T1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4G0T1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4G0T1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4G0T1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q4G0T1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q4G0T1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q4G0T1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q4G0T1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q4G0T1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q4G0T1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q4G0T1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q4G0T1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms