Protein–RNA interactions for Protein: Q495M9

USH1G, Usher syndrome type-1G protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1GQ495M9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USH1GQ495M9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USH1GQ495M9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USH1GQ495M9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USH1GQ495M9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USH1GQ495M9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USH1GQ495M9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USH1GQ495M9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USH1GQ495M9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms