Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF260Q3ZCT1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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