Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms