Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLA2G4EQ3MJ16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLA2G4EQ3MJ16 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms