Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSM12Q3MHD2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSM12Q3MHD2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms