Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A8Q2Y0W8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms