Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTU2Q2VPK5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTU2Q2VPK5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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