Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHOD3Q2V2M9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FHOD3Q2V2M9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms