Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM71Q2Q1W2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM71Q2Q1W2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms