Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRNQ16849 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRNQ16849 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRNQ16849 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRNQ16849 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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