Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN1Q16799 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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